Genini (jap. 下忍, Genini? ninja niższej rangi), absolwenci akademii, łączeni są w trzyosobowe grupy (zwykle mieszane: często składają się z dwóch chłopców i jednej dziewczyny – zapewne dlatego, że tych drugich jest po prostu mniej), których skład dobierany jest na podstawie indywidualnych umiejętności jej członków tak, aby ich zdolności się uzupełniały. Na tej zasadzie Naruto Uzumaki, najgorszy uczeń akademii, trafia do jednej grupy wraz z Sasuke Uchihą, najlepszym studentem na roku, oraz Sakurą Haruno, która doskonale zna podstawy teoretyczne i posiada wspaniałą kontrolę czakry, choć ma małe jej zasoby.
Innymi przykładami są drużyna Kurenai, specjalizująca się w tropieniu i przetrwaniu w trudnych warunkach oraz drużyna Gaia Maito, będąca drużyną typowo ofensywną (wykorzystywanie taijutsu oraz broni). Wspierane są również sprawdzone wzorce: członkowie drużyny Asumy są dziećmi jōninów, którzy tworzyli drużynę w poprzednim pokoleniu.

Sformowane w ten sposób drużyny przekazywane są pod opiekę jōninowi, który czasami przeprowadza dodatkowy sprawdzian umiejętności członków grupy (test dzwoneczkowy przekazywany przez pokolenia w Konosze: Trzeci Hokage, Jiraiya, Czwarty Hokage, Kakashi).

Drużyny geninów wdrażane są w gospodarkę wioski poprzez misje, za których wykonanie osada otrzymuje zapłatę. Zwykle przydzielane są im misje ocierające się o obowiązki domowe oznaczane literą D, czasami zaś (wyjątkowo rzadko) misje oznaczane literą C, które zawierają już elementy typowych zadań shinobi. Przewodzący ich wykonaniu jōnin ma sposobność kontynuowania szkolenia tak poszczególnych członków drużyny, jak i całej grupy.